В первенстве России «Якутия» принимает участие второй раз. В сезоне 2011/12 она заняла 12-е место (среди 13 команд). В 36 матчах якуты набрали 29 очков (7 побед, 8 ничьих, 21 поражение, разница забитых и пропущенных мячей 38-76).

Нынешний сезон складывается для представителей «алмазной республики» гораздо успешнее. На сегодняшний день она занимает 8-е место, набрав 17 очков (4 победы, 5 ничьих, 5 поражений, разница забитых и пропущенных мячей 15-21). На своем поле «Якутия» набрала 11 очков (6 матчей: 3 победы, 2 ничьи, 1 поражений, разница забитых и пропущенных мячей 8-6), на чужом – 6 (8 матчей (1 победа, 3 ничьих, 4 поражения, разница забитых и пропущенных мячей 7-15). По количеству очков, набранных на своем поле. «Якутия» делит восьмое-девятое места; на чужом – пятое-шестое.

Самая крупная победа – 2:0 («Сибирь-2»), самое крупное поражение – 1:6 («Динамо»). Пять раз «Якутия» получала право на пробитие пенальти (четыре из них – в матчах против «Сибири-2»). Четыре удара достигли цели, а вот Константин Мальцев не смог переиграть голкипера «Сибири-2». В ворота «Якутии» было назначено три пенальти (два реализованы).

В составе «Якутии» на поле выходил 21 футболист. Во всех 14 играх приняли участие вратарь Кирилл Музыка, защитник Сергей Федотов, полузащитники Павел Галюкшев и Михаил Немцов. Голы забивали 7 футболистов. Самый результативный – Юрий Иванов (6 забитых мячей).