В 2007-2011 годах ФК «Сахалин» сыграл десять матчей в рамках Кубка России. На счету островной команды три победы, четыре ничьи (две победы в сериях послематчевых пенальти и два поражения) и три поражения. Футболистам «Сахалина» удалось забить в ворота соперников 10 мячей: по 3 гола – «Смене» и «Океану»; 2 – «Амуру»; по 1 – «СКА-Энергия» и «Сатурну». В первом тайме «Сахалин» забил 4 гола, во втором тайме – 5, в дополнительное время» - 1. В ворота «Сахалина» было забито 11 мячей. Чаще всего этого добивались футболисты «Смены» - 6. Два гола «Сахалин» пропустил от «Амура», по одному – от «СКА-Энергия», «Сатурна» и «Мостовика-Приморья». В первом тайме в ворота «Сахалина» забили 6 мячей, во втором тайме – 4, в дополнительное время – 1.
Все матчи «Сахалина» в Кубке России (на 01.08.2012)
| 29.04.2007 | 1/256 | «Сахалин» - «Смена» | 0:2 | Данильченко, Рыков |
|---|---|---|---|---|
| 04.05.2008 | 1/256 | «Сахалин» - «Океан» | 0:0, 5:4 п. | |
| 27.05.2008 | 1/128 | «Смена» - «Сахалин» | 4:1 | Лодис (19, 33п), Левин (30), Рудовский (88) – Лужанков (48п) |
| 26.05.2009 | 1/128 | «Сахалин» - «Океан» | 1:0 | Алексеевцев (36) |
| 18.06.2009 | 1/64 | «Амур» - «Сахалин» | 2:2, 4:3 п. | Харитонов (10, 34) – Штынь (25), Селистровский (84) |
| 03.05.2010 | 1/128 | «Сахалин» - «Смена» | 2:0 | Бондаренко (29), Хинчагов (90+). |
| 15.06.2010 | 1/64 | «Океан» - «Сахалин» | 0:2 | Бондаренко (50п, 65). |
| 01.07.2010 | 1/32 | «Сахалин» - «СКА-Энергия» | 1:1, 3:2 п | Селистровский (110) – Недорезов (91) |
| 14.07.2010 | 1/16 | «Сахалин» - «Сатурн» | 1:1, 3:4 п. | Бондаренко (23) – Якубко (68). |
| 11.05.2011 | 1/256 | «Мостовик-Приморье» - «Сахалин» | 1:0 | Обозный (51) |
